Datos de sensores ambientales

Sensor.Community es una red global de sensores impulsada por la comunidad que crea Open Environmental Data. Los datos se recopilan a partir de sensores de todo el mundo. Cualquiera puede comprar un sensor y colocarlo donde quiera. Las API para descargar los datos están en GitHub y los datos están disponibles libremente bajo la Database Contents License (DbCL).

Los datos están en S3, así que podemos usar la función de tabla s3 para crear una tabla a partir de los archivos. También podemos consultar los datos directamente. Veamos algunas filas antes de intentar insertarlos en ClickHouse:

SELECT *
FROM s3(
    'https://clickhouse-public-datasets.s3.eu-central-1.amazonaws.com/sensors/monthly/2019-06_bmp180.csv.zst',
    'CSVWithNames'
   )
LIMIT 10
SETTINGS format_csv_delimiter = ';';

Los datos están en archivos CSV, pero usan punto y coma como delimitador. Las filas tienen este aspecto:

┌─sensor_id─┬─sensor_type─┬─location─┬────lat─┬────lon─┬─timestamp───────────┬──pressure─┬─altitude─┬─pressure_sealevel─┬─temperature─┐
│      9119 │ BMP180      │     4594 │ 50.994 │  7.126 │ 2019-06-01T00:00:00 │    101471 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        19.9 │
│     21210 │ BMP180      │    10762 │ 42.206 │ 25.326 │ 2019-06-01T00:00:00 │     99525 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        19.3 │
│     19660 │ BMP180      │     9978 │ 52.434 │ 17.056 │ 2019-06-01T00:00:04 │    101570 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        15.3 │
│     12126 │ BMP180      │     6126 │ 57.908 │  16.49 │ 2019-06-01T00:00:05 │ 101802.56 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        8.07 │
│     15845 │ BMP180      │     8022 │ 52.498 │ 13.466 │ 2019-06-01T00:00:05 │    101878 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │          23 │
│     16415 │ BMP180      │     8316 │ 49.312 │  6.744 │ 2019-06-01T00:00:06 │    100176 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        14.7 │
│      7389 │ BMP180      │     3735 │ 50.136 │ 11.062 │ 2019-06-01T00:00:06 │     98905 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        12.1 │
│     13199 │ BMP180      │     6664 │ 52.514 │  13.44 │ 2019-06-01T00:00:07 │ 101855.54 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │       19.74 │
│     12753 │ BMP180      │     6440 │ 44.616 │  2.032 │ 2019-06-01T00:00:07 │     99475 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │          17 │
│     16956 │ BMP180      │     8594 │ 52.052 │  8.354 │ 2019-06-01T00:00:08 │    101322 │ ᴺᵁᴸᴸ     │ ᴺᵁᴸᴸ              │        17.2 │
└───────────┴─────────────┴──────────┴────────┴────────┴─────────────────────┴───────────┴──────────┴───────────────────┴─────────────┘

Usaremos la siguiente tabla MergeTree para almacenar los datos en ClickHouse:

CREATE TABLE sensors
(
    sensor_id UInt16,
    sensor_type Enum('BME280', 'BMP180', 'BMP280', 'DHT22', 'DS18B20', 'HPM', 'HTU21D', 'PMS1003', 'PMS3003', 'PMS5003', 'PMS6003', 'PMS7003', 'PPD42NS', 'SDS011'),
    location UInt32,
    lat Float32,
    lon Float32,
    timestamp DateTime,
    P1 Float32,
    P2 Float32,
    P0 Float32,
    durP1 Float32,
    ratioP1 Float32,
    durP2 Float32,
    ratioP2 Float32,
    pressure Float32,
    altitude Float32,
    pressure_sealevel Float32,
    temperature Float32,
    humidity Float32,
    date Date MATERIALIZED toDate(timestamp)
)
ENGINE = MergeTree
ORDER BY (timestamp, sensor_id);

Los servicios de ClickHouse Cloud tienen un clúster llamado default. Usaremos la table function s3Cluster, que lee archivos de S3 en paralelo desde los nodos del clúster. (Si no tienes un clúster, simplemente usa la función s3 y elimina el nombre del clúster.)

Esta consulta tardará un poco: son aproximadamente 1,67 T de datos sin comprimir:

INSERT INTO sensors
    SELECT *
    FROM s3Cluster(
        'default',
        'https://clickhouse-public-datasets.s3.amazonaws.com/sensors/monthly/*.csv.zst',
        'CSVWithNames',
        $$ sensor_id UInt16,
        sensor_type String,
        location UInt32,
        lat Float32,
        lon Float32,
        timestamp DateTime,
        P1 Float32,
        P2 Float32,
        P0 Float32,
        durP1 Float32,
        ratioP1 Float32,
        durP2 Float32,
        ratioP2 Float32,
        pressure Float32,
        altitude Float32,
        pressure_sealevel Float32,
        temperature Float32,
        humidity Float32 $$
    )
SETTINGS
    format_csv_delimiter = ';',
    input_format_allow_errors_ratio = '0.5',
    input_format_allow_errors_num = 10000,
    input_format_parallel_parsing = 0,
    date_time_input_format = 'best_effort',
    max_insert_threads = 32,
    parallel_distributed_insert_select = 1;

Esta es la respuesta: muestra el número de filas y la velocidad de procesamiento. ¡Se insertan a una tasa de más de 6 millones de filas por segundo!

0 rows in set. Elapsed: 3419.330 sec. Processed 20.69 billion rows, 1.67 TB (6.05 million rows/s., 488.52 MB/s.)

Veamos cuánto espacio de almacenamiento en disco se necesita para la tabla sensors:

SELECT
    disk_name,
    formatReadableSize(sum(data_compressed_bytes) AS size) AS compressed,
    formatReadableSize(sum(data_uncompressed_bytes) AS usize) AS uncompressed,
    round(usize / size, 2) AS compr_rate,
    sum(rows) AS rows,
    count() AS part_count
FROM system.parts
WHERE (active = 1) AND (table = 'sensors')
GROUP BY
    disk_name
ORDER BY size DESC;

El 1,67 T se comprime hasta 310 GiB y hay 20 690 millones de filas:

┌─disk_name─┬─compressed─┬─uncompressed─┬─compr_rate─┬────────rows─┬─part_count─┐
│ s3disk    │ 310.21 GiB │ 1.30 TiB     │       4.29 │ 20693971809 │        472 │
└───────────┴────────────┴──────────────┴────────────┴─────────────┴────────────┘

Analicemos los datos ahora que están en ClickHouse. Observa que la cantidad de datos aumenta con el tiempo a medida que se despliegan más sensores:

SELECT
    date,
    count()
FROM sensors
GROUP BY date
ORDER BY date ASC;

Podemos crear un gráfico en la SQL Console para visualizar los resultados:

Esta consulta cuenta el número de días demasiado calurosos y húmedos:

WITH
    toYYYYMMDD(timestamp) AS day
SELECT day, count() FROM sensors
WHERE temperature >= 40 AND temperature <= 50 AND humidity >= 90
GROUP BY day
ORDER BY day ASC;

A continuación se muestra una visualización del resultado: